Projects5rfbrl

ФОРМА 1. ДАННЫЕ О ПРОЕКТЕ
1.1.1. Название проекта:
Развитие методов таксономической диагностики животных в исследовании биоразнообразия
1.1.2. Название проекта на английском языке:
Development of methods of taxonomical diagnostics in study of biodiversity
1.2.1. Вид конкурса:
а - Инициативные проекты
1.2.2. Область знания:
04 - БИОЛОГИЯ И МЕДИЦИНСКАЯ НАУКА
1.3.1. Научная дисциплина - основной код: 04-110 Зоология

1.3.2. Научная дисциплина - дополнительные коды: 04-110 Зоология

1.4. Ключевые слова:
диагностика, систематика, современные и вымершие группы, жесткокрылые, наездники-ихневмониды, голотурии, офиуры, медузы, политомические многовходовые определители, интернет
1.5. Аннотация:
Современные технические возможности позволяют существенно изменить методы диагностики организмов. Политомические многовходовые ключи могут значительно ускорить процедуру определения. Кроме того, они применимы в условиях неполноты имеющихся диагностических признаков, что особенно важно при определении ископаемых остатков. Предлагаемый проект имеет целью совершенствование диагностики, создание новых типов определителей, которые будут совмещать в себе многовходовость, политомию, преимущества компьютерной сортировки признаков. Основой этих определителей станет программа WebKeys-x, разработанная настоящим коллективом и уже апробированная на больших массивах данных. В качестве объектов, для которых будут создаваться эти определители, выбраны жесткокрылые и перепончатокрылые насекомые, а также медузы, голотурии и офиуры, для некоторых групп из которых уже частично подготовлены отдельные блоки определителей, в том числе работающие в Интернете [http://www.zin.ru/ANIMALIA/Coleoptera/rus/atlas~.htm, [http://www.zin.ru/ANIMALIA/Coleoptera/rus/fossils.htm].
1.6. Количество ученых - основных исполнителей:
10
1.7. Сроки выполнения:
2009-2011
1.8. Объем финансирования на 2009 год (в руб.):
350000
Подпись руководителя проекта:

ФОРМА 2. ДАННЫЕ О РУКОВОДИТЕЛЕ И ОСНОВНЫХ ИСПОЛНИТЕЛЯХ
2.1.1. Фамилия, Имя, Отчество:
Кирейчук Александр Георгиевич

ФОРМА 4. СОДЕРЖАНИЕ ИНИЦИАТИВНОГО ПРОЕКТА
4.1. Фундаментальная научная проблема, на решение которой направлен проект:
Проект направлен на развитие методов диагностики, а также диагностики различных элементов биоразнообразия современных и вымерших фаун с использованием современных достижений, в том числе новых компьютерных технологий и на создание интерактивных определителей, работающих в Интернете.
4.2. Конкретная фундаментальная задача в рамках проблемы, на решение которой направлен проект:
В ходе работы над проектом будут анализироваться все доступные диагностические признаки современных и вымерших жесткокрылых насекомых, наездников семейства Ichneumonidae, голотурий и офиур, в том числе привлекаться новые признаки, обнаруженные в ходе работы над проектом, для создания полных баз данных, позволяющих проводить определение представителей изученных групп даже по существенно неполным частям организмов. Предполагается пересмотреть диагностическое значение различных признаков с целью найти их сопоставимость у современных и вымерших групп. Эти базы данных будут использованы в разработанной и совершенствуемой коллективом программе WebKey-x и установлены на серверах ЗИН РАН и Санкт Петербургского государственного университета и будут доступны в Интернете. Решение этой задачи скажется во многих зоологических исследованиях, а созданные в ходе работы над проектом определители на русском и английском языках, доступные в Интернете, будут использоваться научной общественностью во многих странах мира.
4.3. Предлагаемые методы и подходы:
Для решения поставленных задач будут использованы как широко распространенные традиционные и оригинальные методики таксономических, морфологических и палеонтологических исследований, анализа признаков и разработки диагноза таксонов, так и компьютерные подходы, в том числе с применением веб-технологий. Для развития диагностики будут использованы многочисленные матрицы таксон/признак, имеющиеся в публикациях, посвященных кладистическому анализу конкретных групп. Разработанная коллективом программа WebKey-x позволяет вести определение объектов с помощью многовходовых политомических ключей, существенно изменяющих процедуру идентификации как качественно (можно использовать не все, а часть диагностических признаков и в любом сочетании), так и количественно (сокращается время, которое обычно тратится на определение с помощью традиционных ключей), а также позволяющих идентифицировать животных даже по отдельным органам или при отсутствии важных для определения признаков. Это обстоятельство открывает большие возможности в определении как неполных рецентных экземпляров, так и остатков вымерших организмов. Наполнение баз данных будет осуществляться разработанной коллективом программой Swingfiller, позволяющая оптимально структурировать различные данные, необходимые для определения, в том числе иллюстрации и ссылки на ресурсы Интернета.

2009 г. – Оценка значения различных признаков, ранее используемых для диагностики, а также поиск новых признаков, приемлемых для диагноза современных и вымерших групп жуков, ихневмонид, голотурий, медуз и офиур. Отладка разработанной программы Swingfiller, а также новых программ, создание баз данных по диагностическим признакам отдельных групп, помещение их в Интернете, подготовка оригинальных иллюстраций для определителей, формирование новых гипертекстовых страниц для Атласов указанных выше групп животных.

2010 г. – Проведение сравнительно-морфологических исследований современных и вымерших представителей жесткокрылых, ихневмонид, голотурий, медуз и офиур. Дальнейшее совершенствование методов диагностики и создание политомических ключей, проработка вариантов переноса системы на другие аппаратные платформы и операционные системы, а также формирование не менее 500 новых гипертекстовых страниц для Атласов выбранных групп, а также баз таксономических данных и матриц признаков для определителей.

2011 г. – Дальнейшие сравнительно-морфологические исследований и формализация диагностичеких признаков для баз данных. Размещение в Интернете ключей по разработанным в ходе выполнения проекта группам (см. выше); анализ и оптимизация сетевых компонентов системы, продолжение наполнения гипертекстовых страниц Атласов жесткокрылых, перепончатокрылых, голотурий, медуз и офиур, а также баз данных для многовходовых политомических определителей.
4.4. Ожидаемые в конце 2009 года научные результаты:
Будут получены оценки различных признаков для диагноза современных и вымерших групп жуков, ихневмонид, голотурий, медуз и офиур. Отлажено программное обеспечение для системы WebKey-x и программа Swingfiller, будет продолжено развитие имеющихся баз данных, созданы новые базы данных по диагностическим признакам отдельных групп. Будет расширено представление ключей для определения WebKey-x в Интернете, будут подготовлены оригинальные иллюстрации для определителей, сформированы новые гипертекстовые страницы для Атласов жесткокрылых, ихневмонид, медуз, голотурий и офиур, а также базы таксономических данных и матрицы признаков для определителей. По материалам исследований будут подготовлены статьи, а сами материалы доложены на различных научных форумах российского и международного уровней.
4.5. Современное состояние исследований в данной области науки, сравнение ожидаемых результатов с мировым уровнем:
В настоящее время интенсивно развиваются различные подходы к обоснованию систем отряда жесткокрылых, семейства ихневмонид, а также медуз, голотурий и офиур, которые опираются преимущественно на группы, представленные в современной фауне. Вместе с тем вымершие фауны остаются почти неизученными или их представители описаны несопоставимым с современными группами образом, поскольку нередко признаки, рассматриваемые важными для диагностики современных групп, полностью отсутствуют у доступных для изучения остатков вымерших организмов. Однако использование определенных наборов сопутствующих признаков позволяет осуществлять вполне надежное определение даже при отсутствии используемых для рецентных форм диагностических особенностей тех или иных таксонов, что всегда применялось опытными палеонтологами. Многовходовые политомические ключи дают возможность отчасти формализовать решение этой задачи. Предполагается осуществлять в ходе выполнения настоящего проекта анализ многих признаков, на которых прежде не акцентировалось внимание исследователей, и составление по ним баз данных, дополняющих базы по традиционным диагностическим признакам.

Все разработанные традиционные способы определения страдают неполнотой и громоздкостью. Многие определители и таблицы в Интернете представлены электронными версиями традиционных одновходовых таблиц. Политомические многовходовые ключи получили в последние десятилетия новый мощный инпульс для развития в связи использованием компьютерных технологий и Интернета. К настоящему времени полные аналоги WebKey-x в Интернете отсутствуют, однако создано несколько перспективных программ, реализующих компьютерные интерактивные многовходовые ключи [IdentifyIt (Linnaeus II) - F. MacIntyre & K. Estep, Netherlands; INTKEY (DELTA) - M. Dallwitz & R. Payne, Australia; LUCID - K. Thiele & G. Rutter, Australia; LYSANDRA - K. Dovgailo, A. Osipov & A. Shumeiko, Belarus; MEKA - C. Meacham, USA; PICKEY (BIKEY) - M. Dianov & A. Lobanov, Russia; TAXEX - E. Butakov & S. Lelekov, Ukraine]. Первые попытки создания многовходовых интерактивных определителей насекомых в Интернете предприняты на сайте "Critical Trend Assesment Program" [C. Dietrich, D.M. Takiya, D.A. Dmitriev - http://ctap.inhs.uiuc.edu]. Однако весьма существенным недостатком этих определителей является то, что в них не учитывается диагностическая ценность используемых признаков. Этот недостаток позволяет устранить система WebKey-x.
4.6. Имеющийся у коллектива научный задел по предлагаемому проекту: полученные ранее результаты:
Исполнители проекта являются известными специалистами по тем или иным группам животных, опубликовавшими около 200 научных статей и монографий по систематике и филогенетике, в том числе определители и ревизии, описания около 500 новых таксонов ранга инфраотряда, надсемейства, семейства, рода и вида (Кирейчук (Kirejtshuk), 1979-2008; Смирнов А.В. (Smirnov A.V.), 1987-2006; Shubina et al., 1998; Смирнов И.С., 1999; Kurochkin & Kirejtshuk, 2003, 2005, 2006; Халаим, 2002, 2004, 2005; Khalaim, 2002, 2003, 2004, 2006(2005) и др.), в том числе и в работе с ископаемыми объектами (Кирейчук, Пономаренко, 1990; Kirejtshuk, 2002, 2005; Kirejtshuk & Poinar, 2006, Bily & Kirejtshuk, 2007, Кирейчук, Пойнар, 2007; Халаим, 2006, 2007; Khalaim, 2007; Смирнов А.В., 1989, 1999; Smirnov A.V., 1999; Kirejtshuk, Kurochkin, Monteiro, 2007; Poinar & Kirejtshuk, 2008; Кирейчук, 2008 и др.). Исполнители работают как с современной, так и с вымершими фаунами. Коллектив имеет серьезный задел в области математической оптимизации и создания алгоритмов и программ для компьютеров (Граничин, Поляк, 2003; Вахитов, Граничина, 2006 и др.). Помимо этого, исполнители проекта многие годы разрабатывают технологии использования компьютеров для определения организмов, в том числе создали программное обеспечение для генерации гипертекстовых страниц на сайтах сервера ЗИН РАН и для создания многовходовых политомических ключей (Лобанов, 1972; Лобанов, 1974; Лобанов, 1975а; Лобанов, 1975б; Лобанов, 1983; Лобанов, Степаньянц, 1993; Лобанов, Дианов, 1994; Лобанов и др., 1995; Дианов, Лобанов, 1997; Лобанов и др., 2002; Lobanov et al., 1981; Lobanov et al., 1996; Lobanov, 1997; Dianov & Lobanov, 1997, Lobanov & Ryss, 1999). В результате в ЗИН РАН разработана модель идеального на настоящее время интерактивного определителя, которая в значительной мере нашла свое воплощение в программе WebKey-x [http://www.zin.ru/projects/webkey-x/index.html], созданной при поддержки РФФИ (грант N 05-07-90179) и на основе которой уже работают в Интернете политомические многовходовые ключи для некоторых жуков и арктических офиур. Программное обеспечение для WebKey-x, созданное математиками Санкт-Петербургского университета, с которыми специалисты ЗИН РАН много лет сотрудничают, в том числе и в рамках указанного проекта РФФИ (О.Н. Граничин, А.Т. Вахитов).

Определители системы WebKey-x должны создать пользователю наиболее благоприятные условия для выбора признака (не в стандартном порядке, а в порядке убывания их диагностической ценности - математической оценки потенциальной возможности разделить имеющийся набор таксонов на минимальные поднаборы; особо оптимизируя эти параметры для наиболее обычных таксонов). Дополнительным удобством является возможность множественного выбора (указания сразу нескольких состояний) и отметки тех состояний, которые не могут иметь место у таксонов текущего набора. Используется подход, при котором исходный набор таксонов вообще не редуцируется, а на каждом шаге только пересчитываются вероятности принадлежности к каждому из таксонов, накопленные за пройденные шаги "образа" определяемого экземпляра. При работе с большими ключами (на десятки и сотни таксонов) создается возможность видеть не все таксоны, а только те, вероятность которых превышает некоторый заданный порог. При обнаружении пользователем ошибки в уже введенных признаках и их состояний программа должна давать возможность "отката" - возврата на один или несколько шагов для исправления ошибки. После завершения определения пользователь сможет получить максимально полный набор сведений о таксоне, обязательно включающий дополнительные дифференцирующие признаки для проверки и рисунки (как тотальные, так и важнейших деталей строения).

Сейчас еще мало попыток создания в Интернете настоящих многовходовых ключей, работающих со стандартными базами данных, например, через интерфейс CGI или ODBC. Но быстрое развитие инструментальных средств глобальной сети Интернет создает новые возможности для интересных реализаций многовходовых ключей, существенно повышающих эффективность диагностики. При поддержке РФФИ (гранты N 96-07-89086, N 99-07-90315 и N 02-07-90105) и ГНТП "Биоразнообразие" (2.1.91.бр) был создан и развивается сайт "Жуки и колеоптерологи" [http://www.zin.ru/Animalia/Coleoptera], получивший широкую известность и популярность. Сайт занимает около 7.6 гигагабайт в русской и английской версиях, а также включает более 3500 видов (4400 веб-страниц) в Атласе. Именно для последнего предполагается в первую очередь создание многовходовых политомических ключей. Рейтинги как сайта, так и Атласа достаточно высоки во многих поисковых системах Интернета и постоянно повышаются по мере разработки новых страниц, ввода новой информации и перевода его текстов на английский язык. На сайте функционирует наиболее многогранная информационно-поисковая система, не имеющая аналогов в современной отечественной и мировой научной практике, которая используется как колеоптерологами, так и специалистами других фундаментальных и прикладных наук. Текущие результаты разработки сайта о жуках докладывались на российских и международных симпозиумах и конференциях (Кирейчук, Лобанов, 2002; Смирнов, Лобанов, 2002; Кирейчук и др., 2003; Кирейчук, Лобанов, 2004; Kirejtshuk & Lobanov, 2003; Kirejtshuk, 2004; Лобанов и др., 2005; Лобанов и др., 2006; Смирнов и др., 2006 и т.д.).
4.7.1. Список основных публикаций коллектива, наиболее близко относящихся к предлагаемому проекту:
1) Кирейчук А.Г. Замечания по проблеме соответствия филогении и системы. Труды Зоол. инст. АН СССР, 1989. Т. 202: 3-19.

2) Кирейчук А.Г. О становлении филлофагии (филлофагизации) среди жуков (Coleoptera). Труды Зоол. инст. АН СССР, 1989. Т. 202: 147-182.

3) Кирейчук А.Г., Пономаренко А.Г. Ископаемые жуки семейств Peltidae и Nitidulidae. Палеонтологический журнал. 1990. N 2: 78-88.

4) Kirejtshuk A.G. Evolution of mode of life as the basis for division of the beetles into groups of high taxonomic rank. In: M. Zunino, X. Belles, M. Blas (Eds.). Advances in Coleopterology, AEC, Barcelona. 1991: 249-262.

5) Кирейчук А.Г. Система, эволюция образа жизни и филогения отряда жуков (Coleoptera). I. Энтомол. обозр., 1994. Т. 73 (2): 266-288.

6) Кирейчук А.Г. Система, эволюция образа жизни и филогения отряда жуков (Coleoptera). II. Энтомол. обозр., 1996, Т. 75 (1): 39-62.

7) Kirejtshuk A.G. On the evolution of anthophilous Nitidulidae (Coleoptera) in tropical and subtropical regions. Bonner Zoologische Beitrage, 1997. Bd. 47 (1-2): 111-134.

8) Kirejtshuk A.G. Nitidulidae (Coleoptera) of the Himalayas and Northern Indochina. Part 1: subfamily Epuraeinae. Koeningstein, Koeltz Scientific Books (Theses Zoologicae, Vol. 28). 1998: 1-489.

9) Kirejtshuk, A.G. Sikhotealinia zhiltzovae Lafer, 1996 - recent representative of the Jurassic coleopterous fauna (Coleoptera, Archostemata, Jurodidae). Труды Зоологического института РАН, 1999. Т. 281: 21-26.

10) Kirejtshuk A.G. On origin and early evolution of the superfamily Cucujoidea (Coleoptera, Polyphaga) Comments on the family Helotidae. The Kharkov Entomological Society Gazette, 2000. Vol. 8 (1): 8-38.

11) Kirejtshuk A.G. & Jelinek J. Preliminary review of genera of the tribe Mystropini with redescriptions and new descriptions of some genera, subgenera and species (Coleoptera: Nitidulidae: Nitidulinae). Folia Heyrovskyana, 2000. Vol. 8 (3-4): 171-192.

12) Kirejtshuk A.G. Notes on the systematics of the African Nitidulidae (Coleoptera). Annales Historico-Naturales Musei Nationalis Hungarici, 2001, Vol. 93: 17-89.

13) Kirejtshuk A.G. Subcortical space as an environment for palaeoendemic and young groups of beetles, using mostly examples from sap-beetles (Nitidulidae, Coleoptera). Proceedings of the second pan-European conference on Saproxylic Beetles (Royal Holloway, University of London, June 2002). People's Trust for endangered species. 2003. 50-56.

14) Tsukada M., A.G. Kirejtshuk, H. Higuchi & T. Furukawa - Epuraea kaszabi Kirejtshuk, a little known nitidulid beetle newly recorded to Japan. Elytra, Tokyo, 2005. Vol. 32 (2): 403-404.

15) Kirejtshuk A.G. A revision of the genus Cupes Fabricius, 1801 from Baltic amber and some notes on taxonomy and composition of the family Cupedidae (Coleoptera, Archostemata). Mitteilungen Geol.-Palaeont. Inst. Univ. Hamburg, 2005, Bd. 89: 55-84.

16) Kirejtshuk A.G. New species of the genus Physoronia (Coleoptera, Nitidulidae) from the Far East and Kryzhanovskiella gen. n. from Australia with taxonomic notes on the Pocadius complex of genera (Coleoptera, Nitidulidae). Annales Historico-Naturales Musei Nationalis Hungarici. 2006. Vol. 98: 122-132.

17) Kirejtshuk A.G. On the fauna of Nitidulidae (Coleoptera, Nitidulidae) from Taiwan with some taxonomical notes. Annales Historico-Naturales Musei Nationalis Hungarici, 2005, Vol. 97: 217-279.

18) Kirejtshuk A.G., Kurochkin A.S. & R. Monteiro. Imagines and larvae of the new species of the genus Nitops Murray, 1864 (Coleoptera, Nitidulidae, Carpophilinae) from Brazil and notes on their bionomics. Russian Entomological Journal, 2007. Vol. 16 (3): 295-309.

19) Kirejtshuk A.G., Barclay M.V.L. On Brachypeplus (Brachypeplus) parallelus and B. (B.) euparallelus sp. nov. from Africa with notes on synonymy in the subgenus Brachypeplus (Coleoptera, Nitidulidae, Cillaeinae). Studies & Reports of District Museum Prague-East. 2007. Vol. 3 (1-2): 115-128.

20) Bily S. & A.G. Kirejtshuk. Philanthoxoides gallicus gen. nov., sp. nov. from the Lowermost Eocene French amber (Coleoptera: Buprestidae). Folia Heyrovskyana, Series A, 2007. Vol. 14 (4): 181-186.

21) Kirejtshuk A.G. & Azar D. (in press): New taxa of beetles of the suborder Polyphaga (Coleoptera, Insecta) from Lebanese amber with evolutionary and systematic comments. Alavesia, Vol. 2: 000–000.

22) Kirejtshuk A.G. & Nel A. (in press): New taxa of Polyphaga from the Lowermost Eocene French amber (Insecta: Coleoptera). Ann. Soc. Entomol. France (N.S.), Vol. 00: 000-000.

23) Kirejtshuk A.G. & Couturier G. (in press): Sap beetles of the tribe Mystropini (Coleoptera: Nitidulidae) associated with inflorescences of the palms cultivated in South America. Ann. Soc. Entomol. France (N.S.), Vol. 00: 000-000.

24) Petrov P.N., A.G. Kirejtshuk, Taxonomy of the crawling water beetle Haliplus zacharenkoi (Coleoptera: Haliplidae), with notes on its ecology, phenology, and distribution. Zoosystematica Rossica, 2007. Vol. 16 (2): 247-249.

25) Kirejtshuk A.G., Herrmann A. A record of Carpophilus (Ecnomorphus) extensus GROUVELLE, 1908 from Europe (Coleoptera: Nitidulidae) with notes on synonymy. Zoosystematica Rossica, 2007. Vol. 16 (2): 251-252.

26) Лобанов А.Л. Логический анализ и классификация существующих форм диагностических ключей. Энтомол. обозр. 1972. Т. 51 (3): 668-681.

27) Лобанов А.Л. Результаты экспериментов с биологическими диагностическими системами на базе ЭВМ "Hаири-С". Биологические исследования на Северо-Востоке Европейской части СССР (Ежегодник Института биологии Коми филиала АH СССР). Сыктывкар. 1975. 162-168.

28) Лобанов А.Л. Математический аппарат для расчета, оценки и сравнения конструктивных параметров диагностических ключей. Зоол. журн. 1975. Т. 54 (4): 485-497.

29) Лобанов А.Л. Принципы построения определителей насекомых с использованием электронных вычислительных машин. - Автореферат диссертации на соискание ученой степени канд. биол. наук. Л.: ЗИH АH СССР, 1983. 19 c.

30) Лобанов А.Л., Дианов М.Б. Диалоговая компьютерная диагностическая система BIKEY и возможности ее использования в энтомологии. Энтомол. обозр. 1994. Т. 73 (2): 465-478.

31) Лобанов А.Л., Смирнов И.С. Место и роль информационных технологий в исследованиях Зоологического института РАН. Фундаментальные зоологические исследования: Теория и методы. (По материалам Международной конференции «Юбилейные чтения, посвященные 170-летию Зоологического института РАН», проходившей 23-25 октября 2002 г.), М.-СПб.: Товарищество научных изданий КМК. 2004. 283-318.

32) Лобанов А.Л., Смирнов И.С., Дианов М.Б., Алимов А.Ф., Кирейчук А.Г., Кривохатский В.А. 2002. Российские зоологические базы данных в Интернете. Труды Всероссийской научной конференции "Научный сервис в сети ИНТЕРНЕТ", г. Новороссийск, 23-28 сентября 2002 г. М.: Изд-во Московского университета, 2002. 51-53.

33) Лобанов А.Л., Степаньянц С.Д. Оптимизация определителя семейств медуз подотряда Filifera (Hydrozoa, Athecata) с помощью компьютерной диагностической системы. Морской планктон. Систематика, экология, распределение. 2 (Исследования фауны морей. Вып. 45 (53)). 1993. 38-50.

34) Лобанов А.Л., Степаньянц С.Д., Дианов М.Б. BIKEY - диалоговая компьютерная программа для определения биологических объектов и ее использование в диагностике книдарий. В кн.: Книдарии. Современное состояние и перспективы исследований. 2 (Труды Зоологического института. Т. 261). 1995. 20-70.

35) L.K.Shubina, S.N.Fedorov, E.V.Levina, P.V.Andriyashenko, A.I.Kalinovsky, V.A.Stonik, I.S.Smirnov. Comparative study on polyxydroxylated steroids from echinoderms. Comp. Biochem. Physiol. 1998. Vol. 119 B: 505-511.

36) Смирнов И.С. Филогения и таксономия высших таксонов офиур. Коллоквиум по иглокожим "Морфогенетические и конструктивные основы становления планов строения высших таксонов иглокожих". 24 марта 1997 г. ПИН, Москва. Бюллетень МОИП, отд.геол., 1999. Т. 74 (1): 78.

37) Смирнов И.С., Лобанов А.Л. Компьютерный определитель по офиурам как база данных для хранения таксономической информации. Коллоквиум по иглокожим "Морфогенетические и конструктивные основы становления планов строения высших таксонов иглокожих". 24 марта 1997 г. ПИН, Москва. Бюллетень МОИП, отд.геол., 1999 , Т. 74 (1): 79.

38) Smirnov I. Class OPHIUROIDEA. In: List of species of free-living invertebrates of Eurasian Arctic seas and adjacent deep waters (ed. by B.I.Sirenko). Explorations of the fauna of the seas. 2001.Vol. 51 (59): 125.

39) Смирнов И.С., Лобанов А.Л. Офиуры Антарктики: коллекции и базы данных. Бюллетень МОИП, отд.геол., 2002 , Т. 77 (1): 80-81.

40) Лобанов А.Л., Кирейчук А.Г., Смирнов И.С., Дианов М.Б., Граничин О.Н. Интернет и интерактивные определители биологических объектов. Научный сервис в сети ИНТЕРНЕТ: Труды Всероссийской научной конференции (19-24 сентября 2005 г., г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2005. 132-134.

41) Лобанов А.Л., Кирейчук А.Г., Смирнов И.С., Граничин О.Н., Вахитов А.Т., Дианов М.Б. 2006. К реализации идеального интерактивного определителя в Интернете для биологических объектов. Научный сервис в сети ИНТЕРНЕТ: Труды Всероссийской научной конференции (18-23 сентября 2006 г., г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2006. 202-204.

42) Смирнов И.С., Лобанов А.Л., Алимов А.Ф., Кирейчук А.Г., Вахитов А.Е. Электронные зоологические коллекции и технологии электронных библиотек. Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции: Сборник тезисов постерных докладов Восьмой Всероссийской научной конференции (RCDL’2006). Суздаль, 17 - 19 октября 2006 г. – Ярославль: Ярославский государственный университет им. П.Г. Демидова, 2006а: 60-61.

43) Смирнов И.С., Лобанов А.Л., Алимов А.Ф., О.Н. Пугачев, А.Г. Кирейчук, В.А. Кривохатский, Граничин О.Н., Вахитов А.Т. Зоологические электронные публикации: коллекции и идентификационные системы. Интернет и современное общество. Труды IX Всероссийской объединенной конференции, (14-16 ноября 2006 г., г. СПбГУ), Санкт-Петербург, 2006б: 115-118.

44) Kurochkin A.S., Kirejtshuk A.G. Description of pupae of sap beetles Epuraea (Dadopora ) guttata (Olivier, 1811) and Meligethes ( Clypeogethes) ruficornis (Marsham, 1802) (Coleoptera: Nitidulidae). Zoosyst. Ross. 2003. Vol. 12 (1): 117-122.

45) Kurochkin A.S., Kirejtshuk A.G. Notes on the synonymy and distribution of some species of the genus Meligethes Stephens, 1830 (Coleoptera: Nitidulidae). Russian Entomol. J. 2005. Vol. 14 (3): 209-215.

46) Kurochkin A.S. & Kirejtshuk A.G. Notes on the synonymy, variability and bionomy of Epuraea (Epuraea) bigutata (Thunberg, 1784) and Epuraea (Epuraea) unicolor (Olivier, 1790) (Coleoptera, Nitidulidae). Russian Entomological J. 2006. Vol. 15 (4): 1-5.

47) Khalaim A.I. A new species of the genus Phradis Forster, 1869 from the USA (Hymenoptera: Ichneumonidae: Tersilochinae). Russian Entomological J, 2002. Vol. 11 (2): 221–222.

48) Khalaim A.I. Two new species of the genus Barycnemis Forster from Mexico (Hymenoptera: Ichneumonidae, Tersilochinae). Zoosystematica Rossica, 2002. Vol. 11 (1): 167–169.

49) Халаим A.И. 2002. Обзор видов рода Gelanes (Hymenoptera, Ichneumonidae, Tersilochinae) Палеарктической области. Вестник зоологии, 2002. Т. 36 (6): 3–12.

50) Khalaim A.I. Review of the Palaearctic subgenus Rugodiaparsis Horstmann, 1971 of the genus Probles Forster, 1869 (Hymenoptera: Ichneumonidae: Tersilochinae). Russian Entomological Journal, 2003. Vol. 12 (1): 75–78.

51) Khalaim A.I. A review of the Palaearctic species of the genera Barycnemis Forst., Epistathmus Forst. and Spinolochus Horstm. (Hymenoptera: Ichneumonidae, Tersilochinae). Proceedings of the Russian Entomological Society. St. Petersburg, 2004. Vol. 75 (1): 46–63.

52) Khalaim A.I. A new species of the genus Phradis Forster with 10–11-segmented antenna from the Ukraine (Hymenoptera: Ichneumonidae, Tersilochinae). Zoosystematica Rossica, 2004(2003). Vol. 12 (2): 243–244.

53) Халаим A.И. Обзор родов Aneuclis F?rster и Sathropterus F?rster (Hymenoptera, Ichneumonidae, Tersilochinae). Энтомологическое обозр., 2004. Т. 83(3): 664–678.

54) Khalaim A.I. New tersilochines from Australia and New Zealand (Hymenoptera: Ichneumonidae, Tersilochinae). Zoosystematica Rossica, 2004. Vol. 13(1): 43–45.

55) Халаим A.И. Обзор подродов Diaparsis s. str. и Pectinoparsis subgen. n. рода Diaparsis Forster (Hymenoptera, Icheumonidae, Tersilochinae). Энтомологическое обозрение, 2005. Т. 84(2): 407–426.

56) Khalaim A.I. New tersilochines from the collection of Natural History Museum, London (Hymenoptera: Ichneumonidae: Tersilochinae). Zoosystematica Rossica, 2006 (2005). Vol. 14(2): 269–273.

57) Смирнов А.В. Соотношение систем ископаемых и современных голотурий семейства Synaptidae. - В кн.: Проблемы изучения ископаемых и современных иглокожих. Таллинн. 1989. 203-217.

58) Smirnov A.V. New apodid holothurians (Holothurioidea, Apodida) from the New Caledonian continental slope collected during "BIOGEOCAL" expedition 1987. Zoosystema, 1997. Vol. 19 (1): 15-26.

59) Smirnov A.V., Bardsley T. M. Myriotrochus antarcticus (Apodida: Myriotrochidae), a new holothurian species from eastern Antarctica. Proceedings of the Royal Society of Victoria, 1997. Vol. 109 (1): 109-111.

60) Smirnov A.V. On the classification of the apodid holothurians R. Mooi and M. Telford (eds), "Echinoderms: San Francisco". A.A. Balkema, Rotterdam. 1998: 517-522.

61) Smirnov A.V. Some remarks on the subgenus Oligotrochus M. Sars, 1866 sensu Heding, 1935 (genus Myriotrochus, Myriotrochidae, Holothurioidea) with descriptions of two new species. Zoosystema, 1999. Vol. 21 (1): 13-27.

62) Smirnov A.V. The origin of the order Apodida (Holothuroidea) and its families. Carnevali M.D.C. and Bonasoro F. (eds.). Echinoderm Research 1998. A.A. Balkema, Rotterdam. 1999: 393-395.

63) Смирнов А.В. Система, эволюция и происхождение отряда Apodida (Holothuroidea). Бюллетень Московского общества испытателей природы. Отделение геологии. 1999. Т. 74 (1): 76-77.

65) Smirnov A.V., Gebruk A.V., Galkin S.V., Shank T. New species of holothurian (Echinodermata, Holothuroidea) from hydrotermal vent habitats. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom. 2000. Vol. 80: 321 328.

66) Смирнов А. В., Смирнов И. С. Новые находки иглокожих в море Лаптевых (по материалам экспедиций 1993-1998 гг.). Исследования фауны морей, 2006. Vol. 56 (64): 93-147.

67) Lobanov A.L., S.D. Stepanjants and M.B. Dianov – 1996 Dialogue Computer System BIKEY as applied to diagnostics of Cnidaria (illustrated by an example of hydroids of the genus Symplectoscyphus). Scientia Marina. Vol. 60(1): 211-220

68) Stepanjants S.D., Dianov M.B. 1997. The computer approach to the study of the morphological and biological peculiarities of Siphonophora Dimophyes arctica Chun,1897). In: Stepanjants S.D., Lobanov A.L., Dianov M.B.(eds.) Data base and computer graphics in Zoological Investigations. Trudi Zoologicheskogo Instituta . Vol. 269:154-165.

69) Stepanjants S.D., Cortese G., Kruglikova S.B., Bjorklund K.R. 2006. Review of bipolarity concepts:History and nd examples from Radiolaria and Medusozoa (Cnidaria). Marine Biology Research. 2: 200-241.

70) Svoboda A., Stepanjants S.D., Ljubenkov J. 2006.Genus Bouillonia (Cnidaria:Hydrozoa:Athecata). Three species from the northern and southern hemispheres, with discussion on bipolar distribution of this genus. Zool. Mededlingen, Leiden

71) Stepanjants S.D., Svoboda A. 2008. The genus Gymnogonos (Anthoathecata: Capitata: Сorymorphidae) – redescription of known species and description of a new species from the North Pacific. Journal of Marine Biological Association of UK. 88(8) (in print)

72) Граничин О.Н., Поляк Б.Т. Рандомизированные алгоритмы оптимизации и оценивания при почти произвольных помехах. М.: Наука, 2003, 291 с.

73) Вахитов А.Т., Граничина O.А. Алгоритмы классификации за минимальное число шагов. Стохастическая оптимизация в информатике. Межвузовский сборник. Издательство Санкт-Петербургского университета 2006, С. 3-12.
4.7.2. Список основных публикаций руководителя проекта в рецензируемых журналах за последние 3 года:
Kirejtshuk A.G. & Poinar G. Haplochelidae, a new family of Cretaceous beeles (Coleoptera, Myxophaga) from Burmese amber. Proc. Entomol. Soc. Washington, 2006. Vol. 108 (1): 155-164.

Soriano C., Kirejtshuk A.G. & Delclos X. The Mesozoic Laurasian family Parandrexidae (Insecta: Coleoptera), new species from the Lower Cretaceous of Spain. Comptes Rendu Palevol (Paleontologie systematique). 2006. Vol. 5: 779-784.

Кирейчук А.Г., Пойнар Дж. Виды двух палеоэндемичных родов жуков-блестянок трибы Nitidulini (Nitidulidae: Coleoptera) из балтийского и доминиканского янтаря. Палеонтологический журнал, 2007. N 6: 39-49.

Кирейчук А.Г. Новые род и вид сверлил (Lymexylidae: Coleoptera) из балтийского янтаря. Палеонтологический журнал, 2008. N 1: 65-67.

Poinar, G., Kirejtshuk A.G. Pleurocarinatus burmitis (Coleoptera: Silvanidae), a new genus and species of silvanin beetles from Early Cretaceous Burmese amber. Proceedings of the Entomological Society of Washington. 2008. Vol. 110 (1): 250-257.

4.8. Перечень оборудования и материалов, имеющихся у коллектива для выполнения проекта:
5 стереомикроскопов МБС;
1 стереомикроскоп Leica MZ16 с фотоаппаратом;
1 стереомикроскоп MC-2 ZOOM;
8 компьютеров;
3 сканера;
3 принтера;
коллекции насекомых, голотурий, медуз и офиур
4.9. Перечень оборудования и материалов, которые необходимо дополнительно приобрести, изготовить или отремонтировать для успешного выполнения проекта:
Для проведения морфологических иссследований по проекту в дополнение к имеющемуся необходимо следующее оборудование:

1) 2 стереомикроскопа MC-2-ZOOM вар 1TD-2 с принадлежностями, необходимыми для работы с мелкими объектами и объемными препаратами – 30-45000 руб. каждый

2) 1 поляризатор для микроскопа Leica MZ16 - 25000 руб.

3) дополнительный объектив для микроскопа Leica MZ16 - 32000 руб.

4) 2 осветителя ВО двойных - 5250 руб. каждый

Кроме того, для создания баз данных и политомических многовходовых определителей целесообразно пополнить имеющуюся оргтехнику следующим оборудованием:

1) 2 мультимедиа-компьютера класса Pentium-IV для разработчиков, необходимые для работы с изображениями (цифровые фотографии, сканографии) и развития Web-сайтов проекта - 30000 руб. каждый

2) 1 сканер для сканирования рисунков к публикациям - 5000 руб.

3) комплектующие для имеющихся компьютеров - 30-40000 руб. (общая сумма)

4) картриджи, тонеры, канцелярские принадлежности и другие расходные материалы - 25000 руб. (общая сумма)
4.10.1. Сроки проведения в г. экспедиции по тематике проекта, если это необходимо:

4.10.2. Ориентировочная стоимость экспедиции (в руб.):

4.10.3. Регион проведения экспедиции:

4.10.4. Название района проведения экспедиции:

Подпись руководителя проекта:

Unless otherwise stated, the content of this page is licensed under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 License